Ca consiste en quoi exactement la programmation multithread ? Un threat est un processus léger qui partage la meme zone mémoire qu'un autre non ? si j'ai bon souvenir...

Je suppose que le fancontrol se lancerait dans un thread séparé et au moment de quitter celui la, le processus père reprendrait le controle et exécuterait la commande qui redonnerait le controle au bios... Quelque chose dans ce goût la ?

tu as tout compris ^^. Pas grand chose d'autres à dire

Pour la gestion des threads, regarde du coté de la norme POSIX. C'est relativement portable et assez simple à mettre en oeuvre.